Применение мумийе разнообразно. Изначально греческое слово «мумиё» было производным от слова «мумия», а само вещество добывалось действительно из мумий. В фармакопее восточной медицины «Тухфатул мумин» («Подарок правоверным»), составленной Мухаммедом Мумином, есть описание загадочного средства.

Ссылаясь на это произведение, А. Шакиров пишет: «В древние времена было принято мумифицировать трупы. Тело усопшего человека обрабатывали медом, смолой, дегтем и другими веществами, после чего оно хранилось нетленно в течение многих веков. Впоследствии могилы иногда обнажались, мумифицированные трупы оказывались на поверхности земли, и невежественные люди принимали останки за подлинное мумиё. Такое снадобье иногда может быть полезным при переломах и травмах, принимать его внутрь ни в коем случае нельзя...».

Считалось, что мумификация возможна при употреблении бальзама (смолы особого дерева жарких стран), и бальзам с течением веков превращается в мистическое мумиё. Но ведь будущие мумии обрабатывались ие только бальзамом, но и другими веществами, в том числе медом. У разных народов, в разных странах были свои рецепты мумифицирования, и уже только по этой причине и трупное мумиё может обладать разными свойствами и находить применение. Считается, что во всех разновидностях этого вещества есть одно общее свойство: они содержат углерод органического происхождения, и, следовательно, по отношению изотопов углерода можно вычислить время образования мумиё. По определениям ученых, встречаются образцы с возрастом от 200 до 2000 лет.

Происхождение  и применение мумиё все еще остается непонятным. Изучают это вещество во многих клиниках и научных лабораториях страны, публикуются десятки статей, существует множество гипотез. Бируни сравнивает мумиё с амброй и другими ароматическими смолами. Ценность его состоит в том, как говорит древний ученый, что оно пригодно «для оказания помощи тому, у кого в теле сломается какая-нибудь кость». По другой версии мумиё — это водный воск, и его получают, фильтруя воду горного потока; вода уходит, а воск остается. Есть мнение, что это окаменевший воск диких пчел. А еще как будто бы в Индийском море есть рыбка, так вот ее растопленный жир после растирания в глиняном горшке тоже становится мумиё.

Современные химики-аналитики считают мумиё продуктом менее романтическим и низводят его до обыкновеннейшего продукта жизнедеятельности лишайников. Его некоторые лечебные свойства связаны с тем, считают они, что лишайники, так же как и грибы или плесень, содержат физиологически активные вешества вроде пенициллина, и эти вещества переходят в мумиё. Некоторые ученые утверждают, что мумиё —это экскременты самых различных животных, среди которых на первом месте стоят летучие мыши и мыши-сеноставки.